Il est toutefois important de se rappeler que les chiens et les chats peuvent être infectés par le virus du Nil occidental, mais qu'ils ne développent pas de signes cliniques, sauf exception. Il est donc toujours préférable de chercher une autre étiologie aux signes neurologiques des patients canins et félins.
Il n'y a pas de vaccin pour les chats et les chiens puisqu'ils semblent peu affectés par le virus. Les recommandations afin de les protéger contre l'infection sont les mêmes que celles diffusées pour les humains. Il s'agit donc d'éviter les piqûres de moustiques. Il est également déconseillé d'utiliser des répulsifs (comme le DEET) chez les animaux, car ils pourraient les ingérer en faisant leur toilette.
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